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磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)平臺(tái)首次搭建 突破研究瓶頸
2022年12月01日 13:36:41
來(lái)源：化工儀器網(wǎng) 作者：宋池 點(diǎn)擊量：4470
近日，廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物基因研究中心聯(lián)合加拿大約克大學(xué)、德國(guó)馬普分子植物生理研究所的研究團(tuán)隊(duì)首次搭建全自動(dòng)在線磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)平臺(tái)，解決了磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究的一大瓶頸。
【化工儀器網(wǎng) 項(xiàng)目成果】近日，廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物基因研究中心聯(lián)合加拿大約克大學(xué)、德國(guó)馬普分子植物生理研究所的研究團(tuán)隊(duì)在Green Chemistry雜志發(fā)表一項(xiàng)研究成果。該團(tuán)隊(duì)首次搭建全自動(dòng)在線磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)平臺(tái)，解決了磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究的一大瓶頸。
蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是目前已知分布最為廣泛的翻譯后修飾。據(jù)估計(jì)，真核生物中有將近1/3的蛋白，能夠在任何時(shí)候被磷酸化。磷酸化修飾在許多生物過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用，目前已知的作用包括但不限于調(diào)控細(xì)胞膜功能、調(diào)控細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、調(diào)控轉(zhuǎn)錄過(guò)程、調(diào)控線粒體功能與能量代謝等。因此，磷蛋白和磷酸化位點(diǎn)的整體表征將有助于我們?nèi)媪私獍麅?nèi)代謝調(diào)控的分子機(jī)制。
液相色譜與串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用 (LC-MS/MS) 由于其高靈敏度和高通量能力，已成為綜合蛋白質(zhì)組表征的強(qiáng)大工具。然而，由于磷酸肽豐度低、電離效率低以及非磷酸肽的信號(hào)抑制，通過(guò) LC-MS/MS 直接表征全細(xì)胞消化物中的磷酸肽通常是不切實(shí)際的。因此，在當(dāng)前的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)中，質(zhì)譜 (MS) 分析之前的靶向富集是必不可少的。
目前，已經(jīng)開(kāi)發(fā)了多種用于磷酸肽富集的材料，但這些通常涉及復(fù)雜的制造過(guò)程和高化學(xué)品消耗。此外，磷酸肽的富集是離線的，需要多個(gè)手動(dòng)步驟，從而使其成為一個(gè)繁瑣的工作流程，有機(jī)溶劑和塑料耗材的消耗量很大。隨著磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)向大規(guī)模任務(wù)的發(fā)展，迫切需要開(kāi)發(fā)一種分析性能優(yōu)異的策略，同時(shí)滿足低試劑和耗材消耗的要求。
為解決這一問(wèn)題，研究團(tuán)隊(duì)合成了一種新型的可重復(fù)使用的磷酸化捕獲柱，用于在線富集磷酸肽，并進(jìn)一步將其與商業(yè)nanoLC-MS/MS系統(tǒng)集成，建立了一個(gè)低成本、低浪費(fèi)的自動(dòng)化在線分析平臺(tái)。在軟件控制下，該平臺(tái)可自動(dòng)連續(xù)富集和分析一批生物樣品中的磷酸肽，無(wú)需操作員干預(yù)。
它不僅獲得了高磷酸位點(diǎn)覆蓋率和重現(xiàn)性的結(jié)果，而且在表征具有不同磷酸化狀態(tài)的肽方面表現(xiàn)出色，從而促進(jìn)了新磷酸位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)。更重要的是，可重復(fù)使用的pho-trap柱和納流裝置中的在線富集極大地有助于減少耗材、溶劑的消耗并節(jié)省磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的勞動(dòng)力。
研究人員表示，隨著磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)向大規(guī)模研究的發(fā)展和低碳經(jīng)濟(jì)的到來(lái)，這種用于磷酸化蛋白質(zhì)組分析的自動(dòng)化在線平臺(tái)有望在未來(lái)推動(dòng)蛋白質(zhì)磷酸化的研究。
(資料來(lái)源：中國(guó)科學(xué)報(bào) )
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